El Centro de Investigación, Desarrollo e Innovación de la Universidad de Cuenca (CIDI) tiene como objetivo reforzar y complementar la investigación, la capacitación y la oferta de servicios científicos y tecnológicos para beneficio de la sociedad. Integrado por docentes, investigadores y ingenieros de la Facultad de Ingeniería, el CIDI desarrolla soluciones innovadoras aplicando tecnología avanzada a diversos problemas.
Entre los proyectos destacados del CIDI se encuentran iniciativas relacionadas con tecnología móvil, noticieros digitales, transmisión de audio y video en tiempo real, aplicaciones para TV Digital, y colaboraciones internacionales como el proyecto IDE (Infraestructura de Datos Espaciales) en asociación con la Agencia Española de Cooperación Internacional.
A mediados del año 2005 se inicia una propuesta en conjunto con las Universidades Universidad de Cuenca, Universidad del Azuay, Universidad Politécnica Salesiana para la creación de un Centro de Investigación conjunto, dicha propuesta se formaliza recién en el 2006 ante el FUNDACYT por medio de la solicitud de fondos CEREPS, la propuesta no fue aceptada pero permite levantar nuevas ideas respecto a la conformación de un ente similar. Para este trabajo no se recibió remuneración alguna, siempre fue ad honoris buscando la posibilidad de abrirse campo para desarrollar investigación e innovación dentro de la Universidad.
A finales del año 2005 nace la propuesta ante el Ing. Fabián Jaramillo para crear un Centro de Investigación en la Facultad de Ingeniería, la cual fue bien aceptada pero que tenía el inconveniente de la falta de fondos para dicha propuesta. Pues entonces la Universidad no podría destinar fondos para este fin. En el mes de diciembre del 2005, se presenta la propuesta de proyecto Ciudad Digital a la representante de OTECEL, Dagmar Thiel, quien apoya dicha propuesta y permite recibir el financiamiento para iniciar proyectos en el 2006. Esta tarea tampoco fue financiada y no se recibió ningún tipo de remuneración para poder preparar las propuestas pues existieron otras tantas propuestas presentadas que no tuvieron éxito.
En octubre de 2006, se obtuvo financiamiento de OTECEL para el proyecto Ciudad Digital, dando inicio a las actividades de investigación en Tecnologías de la Información y Comunicación (TICs), con el objetivo de desarrollar aplicaciones móviles innovadoras. Estas investigaciones allanaron el camino para la introducción de planes de datos para telefonía celular en Ecuador.
En enero de 2007, se estableció oficialmente el Centro de Investigación, Desarrollo e Innovación (CIDI) por decisión del Consejo Directivo de la Facultad de Ingeniería. El CIDI, con autonomía administrativa y financiera, se dedica a reforzar la investigación y la oferta de servicios científicos y tecnológicos para beneficio de la sociedad, desarrollando soluciones innovadoras aplicando tecnología avanzada a diversos problemas.